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El Colegio San José y la iglesia de Nuestra Señora de Balvanera -íntimamente ligados en su historia- forman un solo conjunto significativo que ocupa una importante manzana céntrica. El colegio de los padres bayoneses -invitados por el entonces gobernador de Buenos Aires, Pastor Obligado- comenzó a funcionar en 1858, en una propiedad alquilada frente a la iglesia de Balvanera. Los bayoneses adquirieron terrenos y en 1859, las clases se iniciaron ya en instalaciones propias. A partir de 1871, el colegio fue sucesivamente ampliado. La primera etapa culminó con la construcción de un alto mirador almenado. En 1891, se inauguró la capilla proyectada por el R.P. Pommes según las enseñanzas del arquitecto y teórico francés Eugéne Viollet-Le-Duc. La última ampliación comenzó en 1910. Pablo Hary, ex-alumno y docente de la Escuela de Arquitectura, modificó la torre para instalar un observatorio astronómico. El salón de actos, de 1915, fue resuelto en un estilo suntuosamente ecléctico, y contó con los mayores adelantos de la época. Las sucesivas construcciones siguieron un plan sistemático alrededor de tres patios. Hoy conviven estructuras de impronta neogótica italiana -sobre el sector norte con otras de carácter neoclásico francés, como en las fachadas Sur y la del acceso principal, con su bella marquesina de hierro forjado.
En el Colegio San José, que introdujo en el país la pedagogía francesa -entonces de avanzada-, se formaron personalidades de destacada actuación, como Hipólito Yrigoyen, el perito Moreno, Florentino Ameghino, el cardenal Copello y Luis María Drago, entre otros. Se conservan en el edificio mobiliario, piezas de museo, libros y documentos de gran valor testimonial.
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